More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2184 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  50.94 
 
 		 781 aa  766    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  56.04 
 
 		 977 aa  910    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  54.01 
 
 		 952 aa  863    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  54.62 
 
 		 936 aa  857    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  48.81 
 
 		 948 aa  761    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  100 
 
 		 833 aa  1700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  58.41 
 
 		 869 aa  929    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  75.51 
 
 		 834 aa  1277    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  53.67 
 
 		 568 aa  619  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  39.3 
 
 		 1055 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  33.96 
 
 		 940 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.91 
 
 		 827 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 828 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  29.96 
 
 		 828 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  32.67 
 
 		 833 aa  358  2.9999999999999997e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 837 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 837 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 828 aa  343  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 837 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 849 aa  330  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  32.66 
 
 		 779 aa  319  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  31.16 
 
 		 947 aa  293  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 823 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.95 
 
 		 830 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.78 
 
 		 877 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.78 
 
 		 800 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.78 
 
 		 875 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.55 
 
 		 877 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  30.12 
 
 		 812 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 846 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 824 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 830 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.59 
 
 		 803 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  33.63 
 
 		 753 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.27 
 
 		 921 aa  250  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  29.78 
 
 		 931 aa  250  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  30.8 
 
 		 919 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 920 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  30.16 
 
 		 915 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.33 
 
 		 910 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.38 
 
 		 897 aa  241  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.74 
 
 		 920 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  32.83 
 
 		 869 aa  238  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 922 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 919 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.96 
 
 		 869 aa  224  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.99 
 
 		 912 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  25.44 
 
 		 791 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  28.69 
 
 		 852 aa  218  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 800 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  36.57 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 580 aa  174  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  49.02 
 
 		 425 aa  168  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 478 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  34.39 
 
 		 605 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.68 
 
 		 552 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.53 
 
 		 552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.08 
 
 		 552 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.4 
 
 		 552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  23.31 
 
 		 603 aa  114  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  32.87 
 
 		 565 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  32.57 
 
 		 558 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  32.57 
 
 		 558 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  32.57 
 
 		 558 aa  108  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.13 
 
 		 473 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 516 aa  101  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 587 aa  97.8  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  32.2 
 
 		 557 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  30.52 
 
 		 609 aa  94.7  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 992 aa  93.6  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  34.04 
 
 		 558 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  32.27 
 
 		 537 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 388 aa  89.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  22.96 
 
 		 579 aa  88.2  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  30.6 
 
 		 606 aa  87.8  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.24 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  24.63 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  24.33 
 
 		 495 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  29.75 
 
 		 606 aa  84  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 431 aa  83.2  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.71 
 
 		 495 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 992 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.05 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  36.57 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.5 
 
 		 268 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 264 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  25.79 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  31.36 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  26.6 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.09 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>