173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0293 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  70.4 
 
 		 552 aa  780    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  70.58 
 
 		 552 aa  785    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  100 
 
 		 552 aa  1105    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  69.49 
 
 		 552 aa  781    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  38.59 
 
 		 606 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  37.17 
 
 		 603 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  37.74 
 
 		 558 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  37.55 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  37.55 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  36.81 
 
 		 606 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  38.55 
 
 		 565 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  38.95 
 
 		 579 aa  343  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 605 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 587 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  36.03 
 
 		 557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  35.67 
 
 		 609 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  34.66 
 
 		 537 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 558 aa  293  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  33.27 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  25.6 
 
 		 576 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  33.05 
 
 		 803 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 947 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 833 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 869 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 977 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  34.55 
 
 		 952 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  32.84 
 
 		 910 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  31.77 
 
 		 915 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 948 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  32.85 
 
 		 834 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 920 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 919 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 849 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.57 
 
 		 779 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 828 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  33.04 
 
 		 931 aa  103  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 936 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 940 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  27.02 
 
 		 830 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 828 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 921 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  29.34 
 
 		 753 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.88 
 
 		 827 aa  99.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  32 
 
 		 919 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  29.66 
 
 		 897 aa  97.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  23.89 
 
 		 781 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 824 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 912 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  32.11 
 
 		 922 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.9 
 
 		 877 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  24.69 
 
 		 875 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.9 
 
 		 800 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.66 
 
 		 877 aa  93.6  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 830 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 869 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  25.73 
 
 		 478 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 1055 aa  90.1  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.76 
 
 		 920 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  29.68 
 
 		 828 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 846 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 800 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  33.18 
 
 		 837 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  33.18 
 
 		 837 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  31.95 
 
 		 823 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 837 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  29.21 
 
 		 869 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  25 
 
 		 812 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.84 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  24.33 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.04 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  23.85 
 
 		 791 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  25.33 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  25.23 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  23.1 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  26.53 
 
 		 309 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 298 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 234 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 358 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25.67 
 
 		 317 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 235 aa  53.9  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 384 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 268 aa  53.9  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 454 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  22.51 
 
 		 392 aa  53.9  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  24.59 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  24.32 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  22.22 
 
 		 568 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  26.88 
 
 		 324 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  25.33 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 351 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 189 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  23.96 
 
 		 281 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.91 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 235 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  28.69 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>