191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2584 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  100 
 
 		 605 aa  1219    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  51.32 
 
 		 537 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  48.88 
 
 		 558 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  47.27 
 
 		 516 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  44.99 
 
 		 579 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  41.96 
 
 		 587 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  43.06 
 
 		 609 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  46.4 
 
 		 565 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  42.63 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  37.4 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  37.4 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  37.6 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 603 aa  332  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  36.38 
 
 		 552 aa  327  3e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.98 
 
 		 552 aa  326  7e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.98 
 
 		 552 aa  326  9e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  35.29 
 
 		 552 aa  325  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  38.6 
 
 		 606 aa  323  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  36.51 
 
 		 606 aa  323  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.68 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 947 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 977 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  32.44 
 
 		 922 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.62 
 
 		 877 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.62 
 
 		 800 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.44 
 
 		 875 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  35.34 
 
 		 940 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  34.39 
 
 		 833 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 952 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  30.06 
 
 		 834 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  34.09 
 
 		 869 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  31.6 
 
 		 920 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  28.16 
 
 		 869 aa  117  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 915 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 936 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  25.69 
 
 		 779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 869 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.68 
 
 		 877 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  33.17 
 
 		 931 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 828 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 803 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  31.95 
 
 		 849 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  25.77 
 
 		 753 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.74 
 
 		 828 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  26.05 
 
 		 948 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.81 
 
 		 781 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 910 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 921 aa  107  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 912 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  30.45 
 
 		 919 aa  106  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.84 
 
 		 827 aa  105  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.3 
 
 		 920 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 852 aa  100  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 919 aa  99  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 800 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  23.17 
 
 		 824 aa  97.8  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 846 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  30.38 
 
 		 1055 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.77 
 
 		 897 aa  94.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  24.22 
 
 		 812 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 830 aa  91.3  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  23.52 
 
 		 830 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  28.45 
 
 		 823 aa  87.4  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  25.76 
 
 		 833 aa  87  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.31 
 
 		 837 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.31 
 
 		 837 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  29.74 
 
 		 828 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  28.88 
 
 		 837 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  24.28 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  22.43 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  25.38 
 
 		 791 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  30.46 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 473 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 252 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 703 aa  61.2  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  23.63 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  28.75 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  32.39 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  22.79 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  29.11 
 
 		 235 aa  57  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  29.11 
 
 		 235 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 185 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  31.25 
 
 		 700 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  23.44 
 
 		 268 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  30.87 
 
 		 237 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  23.7 
 
 		 551 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  24.85 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  30.14 
 
 		 425 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  28.75 
 
 		 213 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.53 
 
 		 388 aa  55.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  30.13 
 
 		 238 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 270 aa  54.3  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>