More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1528 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  43.5 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  37.98 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  32.51 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  35.56 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  36.11 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  32.59 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  32.11 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  34.07 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 387 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.23 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  33.57 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05380  Polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 869 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  31.55 
 
 		 869 aa  72.4  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 846 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.54 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  28.44 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2021  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.13 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.95 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  32.86 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  29.34 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  29.34 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  30.46 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  29.68 
 
 		 365 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  39.45 
 
 		 451 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  38.53 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  29.48 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  34.18 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  28.74 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5485  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.06 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 603 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 931 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3007  exopolysaccharide transporter  29.35 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  28.14 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  28.14 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 187 aa  62  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.31 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  30.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  23.78 
 
 		 915 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  36.89 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3303  polysaccharide export protein  28.08 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0200741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  22.64 
 
 		 920 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  31.01 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 910 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  32.18 
 
 		 580 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2951  polysaccharide export protein  34.13 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>