286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2769 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  46.05 
 
 		 812 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  100 
 
 		 846 aa  1693    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  40.03 
 
 		 823 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  39.06 
 
 		 830 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  38.06 
 
 		 800 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 791 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 824 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 830 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.84 
 
 		 828 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.38 
 
 		 827 aa  296  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  31.42 
 
 		 936 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 828 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.11 
 
 		 833 aa  281  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 828 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 952 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 948 aa  278  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 837 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 837 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 837 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.59 
 
 		 834 aa  269  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 1055 aa  262  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.48 
 
 		 781 aa  245  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.89 
 
 		 833 aa  244  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.88 
 
 		 977 aa  244  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 869 aa  234  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.83 
 
 		 852 aa  231  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.2 
 
 		 947 aa  224  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 940 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 919 aa  218  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.33 
 
 		 931 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 915 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 920 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 		 921 aa  210  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 910 aa  205  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.48 
 
 		 922 aa  204  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.95 
 
 		 920 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.3 
 
 		 919 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 912 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 869 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  24.52 
 
 		 849 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 753 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 779 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.08 
 
 		 897 aa  162  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.69 
 
 		 869 aa  160  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28 
 
 		 568 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.08 
 
 		 576 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.7 
 
 		 877 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.7 
 
 		 800 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.7 
 
 		 877 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.7 
 
 		 875 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 803 aa  138  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 580 aa  120  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.53 
 
 		 478 aa  114  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  36.18 
 
 		 425 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 605 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.6 
 
 		 579 aa  95.5  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.15 
 
 		 609 aa  87.8  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.71 
 
 		 552 aa  87.4  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.71 
 
 		 552 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  31.12 
 
 		 516 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  22.7 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.22 
 
 		 552 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  22.64 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.5 
 
 		 992 aa  81.6  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  27.41 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  29.1 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 992 aa  80.5  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  24.43 
 
 		 558 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  24.43 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 387 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  24.43 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.35 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 388 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  24.1 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.26 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  25.78 
 
 		 386 aa  73.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  26.55 
 
 		 606 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 205 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  28.09 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  23.64 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 309 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  22.62 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  27.02 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  22.37 
 
 		 495 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 246 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  26.01 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  23.3 
 
 		 603 aa  69.3  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.15 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  29.34 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.58 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.18 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  24.19 
 
 		 387 aa  67.4  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  24.82 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 393 aa  67  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>