176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4605 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  100 
 
 		 791 aa  1584    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  43.86 
 
 		 800 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  35.44 
 
 		 823 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  35.1 
 
 		 830 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  33.02 
 
 		 830 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  37.54 
 
 		 812 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  30.76 
 
 		 824 aa  409  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  34.49 
 
 		 846 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 828 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 828 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.71 
 
 		 827 aa  278  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 828 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 837 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 837 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  28.44 
 
 		 837 aa  250  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 948 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  26.96 
 
 		 833 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.59 
 
 		 781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  25.44 
 
 		 833 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  29.66 
 
 		 936 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 834 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 1055 aa  205  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  26.03 
 
 		 952 aa  205  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 940 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 919 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 947 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 921 aa  191  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.36 
 
 		 919 aa  190  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 915 aa  190  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  29.18 
 
 		 977 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 803 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.07 
 
 		 910 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.56 
 
 		 852 aa  184  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 922 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 931 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  26.32 
 
 		 869 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  25.42 
 
 		 869 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 912 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 920 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 779 aa  173  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  30.48 
 
 		 897 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  34.11 
 
 		 753 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.15 
 
 		 877 aa  162  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.15 
 
 		 877 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.15 
 
 		 875 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.15 
 
 		 800 aa  160  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  24.43 
 
 		 869 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.72 
 
 		 920 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 849 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.36 
 
 		 568 aa  129  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 580 aa  127  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.8 
 
 		 576 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  22.58 
 
 		 587 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.32 
 
 		 609 aa  90.9  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.04 
 
 		 579 aa  88.2  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  36.3 
 
 		 425 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  22.93 
 
 		 700 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  23.65 
 
 		 603 aa  80.9  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.48 
 
 		 703 aa  76.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  21.23 
 
 		 700 aa  74.7  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 992 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  24.9 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  24.9 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  24.9 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  25.38 
 
 		 605 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  24.47 
 
 		 606 aa  70.5  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  23.87 
 
 		 992 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  22.45 
 
 		 573 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  24.31 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  21.62 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  22.71 
 
 		 516 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.75 
 
 		 358 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.85 
 
 		 552 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  22.49 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  25.57 
 
 		 282 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.2 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.3 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.99 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  25.49 
 
 		 557 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25 
 
 		 362 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  23.88 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  22.62 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  24.89 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 368 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  25.89 
 
 		 262 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 368 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  22.41 
 
 		 281 aa  56.6  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  23.24 
 
 		 551 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  31.28 
 
 		 397 aa  55.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 393 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  26.72 
 
 		 333 aa  55.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.1 
 
 		 375 aa  55.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  21.19 
 
 		 283 aa  54.7  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>