More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1011 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  100 
 
 
388 aa  787    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  69.48 
 
 
387 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  69.39 
 
 
379 aa  502  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  58.44 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  35.23 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  31.62 
 
 
392 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  31.72 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.85 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  30.69 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  34.04 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.5 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 
379 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 
379 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.33 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.85 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  30.48 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.27 
 
 
268 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  30.88 
 
 
386 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.27 
 
 
268 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  31.3 
 
 
283 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  30.85 
 
 
372 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  33.6 
 
 
268 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  31.08 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  29.38 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.61 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.8 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  30.45 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  30.45 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  36.53 
 
 
277 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  30.45 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.45 
 
 
386 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.45 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.45 
 
 
386 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  30.53 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  31.01 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  30.1 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  26.61 
 
 
377 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  31.4 
 
 
282 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.34 
 
 
379 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  32.93 
 
 
281 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  29.51 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  30.45 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  29.08 
 
 
379 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  29.23 
 
 
350 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.07 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  28.3 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  29.58 
 
 
379 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  27.21 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  30.43 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  25.97 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.53 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  29.86 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  27.46 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  27.49 
 
 
352 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.74 
 
 
347 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  29.18 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  29.62 
 
 
298 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  32.52 
 
 
277 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  28.52 
 
 
390 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.66 
 
 
396 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.47 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  34.27 
 
 
269 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.39 
 
 
384 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  24.77 
 
 
392 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  27.82 
 
 
348 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  28.18 
 
 
378 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  24.77 
 
 
392 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  28.47 
 
 
362 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  27.06 
 
 
391 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  24.4 
 
 
392 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  24.4 
 
 
387 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  24.4 
 
 
387 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.39 
 
 
390 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  28.83 
 
 
385 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  24.16 
 
 
397 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  32.27 
 
 
356 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  24.44 
 
 
392 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  28.62 
 
 
391 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  27.48 
 
 
407 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.46 
 
 
396 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  26.69 
 
 
407 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.46 
 
 
391 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.46 
 
 
391 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.84 
 
 
396 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  25.61 
 
 
374 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.1 
 
 
446 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  29.12 
 
 
348 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>