More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0428 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  56.29 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  45.02 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  47.09 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  41.58 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  37.24 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  45.18 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  43.37 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  38.89 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  38.02 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  37.62 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  40.72 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  36.73 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  42.6 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  43.79 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  36 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  39.6 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  37.43 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  41.32 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.1 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  37.37 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  36.75 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.77 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.77 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.77 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  35.58 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  34.76 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.45 
 
 		 378 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 377 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  33.5 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  34.1 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.93 
 
 		 376 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  32.2 
 
 		 317 aa  85.1  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  32.2 
 
 		 378 aa  84.7  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  33.33 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  42.35 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  34.34 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.81 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.81 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.81 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.81 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.81 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  32.04 
 
 		 373 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 378 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  42.35 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  32.52 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.15 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  34.27 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  33.15 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  29.65 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.65 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.65 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.65 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  29.65 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 282 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  30.15 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  39.56 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.73 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  32.6 
 
 		 378 aa  75.1  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  32.65 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  31.36 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  30.18 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 393 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 277 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  27.09 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 391 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 495 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 495 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  36.22 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  42.22 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>