More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3062 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  56.69 
 
 		 936 aa  873    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  49.09 
 
 		 781 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  60.43 
 
 		 869 aa  949    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  48.23 
 
 		 948 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  56.01 
 
 		 952 aa  888    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  75.51 
 
 		 833 aa  1277    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  100 
 
 		 834 aa  1689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  55.51 
 
 		 977 aa  892    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  53.67 
 
 		 568 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  37.25 
 
 		 1055 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  34.01 
 
 		 940 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  32.18 
 
 		 828 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  31.63 
 
 		 827 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.97 
 
 		 828 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  32.66 
 
 		 833 aa  357  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 837 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 837 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  31.93 
 
 		 828 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 837 aa  350  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  30.74 
 
 		 849 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 779 aa  310  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 823 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 830 aa  293  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  29.25 
 
 		 812 aa  274  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 824 aa  273  7e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  28.51 
 
 		 947 aa  268  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  29.64 
 
 		 846 aa  267  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.36 
 
 		 830 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 803 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  35.02 
 
 		 753 aa  260  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 920 aa  258  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 919 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  31.45 
 
 		 921 aa  247  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  29.95 
 
 		 931 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  29.66 
 
 		 915 aa  244  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  29.93 
 
 		 922 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.31 
 
 		 910 aa  237  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.52 
 
 		 920 aa  234  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 919 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 912 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.84 
 
 		 877 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 869 aa  229  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.19 
 
 		 800 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.19 
 
 		 877 aa  225  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  33.19 
 
 		 875 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  33.51 
 
 		 897 aa  224  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  31.5 
 
 		 800 aa  217  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.51 
 
 		 869 aa  217  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 852 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  36.01 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  27.93 
 
 		 580 aa  162  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  46.43 
 
 		 425 aa  161  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  30.06 
 
 		 605 aa  121  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.7 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.82 
 
 		 552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.25 
 
 		 552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  33.48 
 
 		 565 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.03 
 
 		 603 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.85 
 
 		 552 aa  108  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  33.66 
 
 		 558 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  33.66 
 
 		 558 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  33.66 
 
 		 558 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 473 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  34.83 
 
 		 516 aa  94.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  29.97 
 
 		 557 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  29.91 
 
 		 606 aa  91.3  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  26.48 
 
 		 992 aa  90.5  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  26.58 
 
 		 606 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 587 aa  89.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  29.25 
 
 		 609 aa  88.6  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 358 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 537 aa  87.4  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  25.6 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  29.32 
 
 		 579 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 551 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  26.93 
 
 		 992 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 558 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  24.23 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.94 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  32.65 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.71 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 347 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  33.97 
 
 		 264 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.13 
 
 		 495 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.63 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  32.87 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.77 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.6 
 
 		 362 aa  77  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 431 aa  76.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  24.09 
 
 		 700 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 283 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.57 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.91 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  28.26 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.74 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.95 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>