More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0289 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  92.04 
 
 		 992 aa  1779    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  100 
 
 		 992 aa  1959    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 1070 aa  313  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 823 aa  226  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1613  polysaccharide export protein  22.2 
 
 		 830 aa  122  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  27.15 
 
 		 947 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 478 aa  111  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 830 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  32.03 
 
 		 281 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 948 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 295 aa  99.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 823 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 828 aa  98.6  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  26.1 
 
 		 580 aa  96.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  27.73 
 
 		 936 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 1055 aa  95.1  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  24.23 
 
 		 824 aa  94.7  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  24.4 
 
 		 828 aa  93.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 833 aa  93.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  26.16 
 
 		 952 aa  93.2  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  26.45 
 
 		 940 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  30.12 
 
 		 264 aa  91.3  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  27.02 
 
 		 781 aa  90.5  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  26.48 
 
 		 834 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 371 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  27.36 
 
 		 830 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  29.54 
 
 		 282 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 347 aa  87  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.51 
 
 		 282 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  31.84 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.36 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  28.1 
 
 		 700 aa  84.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  22.71 
 
 		 827 aa  84  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.96 
 
 		 333 aa  83.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  27.03 
 
 		 268 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 379 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  24.06 
 
 		 828 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.06 
 
 		 846 aa  81.6  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.14 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  27.37 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  24.04 
 
 		 812 aa  81.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.14 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.14 
 
 		 391 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 283 aa  80.9  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 391 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.14 
 
 		 391 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 392 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  23.07 
 
 		 869 aa  80.1  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.63 
 
 		 352 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 753 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  27.17 
 
 		 268 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.91 
 
 		 422 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.45 
 
 		 703 aa  80.1  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.44 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  28.47 
 
 		 700 aa  79.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.44 
 
 		 400 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  24 
 
 		 837 aa  79  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  27.17 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.68 
 
 		 920 aa  78.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  25.86 
 
 		 912 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  28.69 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 920 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  24 
 
 		 837 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  24 
 
 		 837 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  25.93 
 
 		 915 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 391 aa  77  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  21.8 
 
 		 910 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  27.45 
 
 		 264 aa  76.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  29.36 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25 
 
 		 919 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  24.58 
 
 		 849 aa  75.1  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  26.78 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.1 
 
 		 576 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 268 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 379 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  27.48 
 
 		 350 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 919 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  22.01 
 
 		 977 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.22 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 791 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  27.27 
 
 		 317 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  25 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.76 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.76 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.76 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 393 aa  72  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.76 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.76 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>