244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003530 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  66.67 
 
 		 703 aa  976    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  86.29 
 
 		 700 aa  1274    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  100 
 
 		 700 aa  1438    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  24.96 
 
 		 580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  24.61 
 
 		 830 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  25 
 
 		 940 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  23.99 
 
 		 947 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  24.3 
 
 		 781 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.38 
 
 		 478 aa  104  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  25.32 
 
 		 948 aa  104  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  21.74 
 
 		 828 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  21.89 
 
 		 828 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  22.71 
 
 		 931 aa  99.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 910 aa  99.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  22.07 
 
 		 827 aa  94.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  22.33 
 
 		 869 aa  94  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.83 
 
 		 920 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  21.35 
 
 		 828 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  23.79 
 
 		 919 aa  89  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 919 aa  88.6  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  24.62 
 
 		 1055 aa  88.2  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  26.33 
 
 		 833 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  22.31 
 
 		 920 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.49 
 
 		 897 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  25.6 
 
 		 834 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  22.18 
 
 		 800 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 992 aa  84.3  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  25.39 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  21.84 
 
 		 837 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 869 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  25.05 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 992 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.07 
 
 		 915 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.05 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 		 921 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  24.84 
 
 		 936 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  25.17 
 
 		 912 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 753 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  23.26 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 803 aa  78.2  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  25.9 
 
 		 824 aa  76.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  22.14 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  22.14 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  25.59 
 
 		 922 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  21.23 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  22.83 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 358 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.69 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  26.35 
 
 		 295 aa  72.8  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 849 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  22.82 
 
 		 869 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.82 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  23.82 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  22.68 
 
 		 823 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  22.91 
 
 		 830 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  24.05 
 
 		 977 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  35.25 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  35.25 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  24.82 
 
 		 846 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  23.36 
 
 		 852 aa  68.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  25.28 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  35.25 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  21.86 
 
 		 812 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  25.44 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  23.43 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.94 
 
 		 877 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.57 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  21.88 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  25.48 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  26.61 
 
 		 268 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  25.91 
 
 		 357 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  28.67 
 
 		 579 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  29.63 
 
 		 606 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  22.83 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  22.83 
 
 		 875 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 495 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  22.83 
 
 		 800 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  22.97 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  25.1 
 
 		 282 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 779 aa  60.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  27.22 
 
 		 191 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 603 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  32.85 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 264 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  23.55 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  22.18 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  24.9 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>