218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1613 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1613  polysaccharide export protein  100 
 
 
830 aa  1648    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  25.03 
 
 
823 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  24.06 
 
 
992 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  22.54 
 
 
992 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  24.77 
 
 
1070 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  33.54 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.37 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.07 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.09 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.09 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  25.37 
 
 
377 aa  70.5  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.78 
 
 
387 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.87 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.87 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.52 
 
 
379 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.52 
 
 
386 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.09 
 
 
379 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.09 
 
 
379 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.09 
 
 
379 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.09 
 
 
386 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.09 
 
 
379 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.09 
 
 
386 aa  65.5  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  23.37 
 
 
393 aa  64.3  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.14 
 
 
378 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  25.76 
 
 
373 aa  62.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  26.44 
 
 
295 aa  62  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  23.42 
 
 
281 aa  62  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  27.03 
 
 
333 aa  61.6  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  25.82 
 
 
277 aa  61.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  21.55 
 
 
378 aa  61.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  26.51 
 
 
358 aa  60.8  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  22.63 
 
 
376 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  26.32 
 
 
356 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  28.19 
 
 
384 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  31.35 
 
 
385 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  27.13 
 
 
402 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  31.35 
 
 
391 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  25.68 
 
 
352 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  30.71 
 
 
206 aa  58.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  25.58 
 
 
358 aa  58.5  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.7 
 
 
393 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.18 
 
 
282 aa  58.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  21.67 
 
 
378 aa  57.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  25.41 
 
 
379 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  24.29 
 
 
390 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  29.26 
 
 
440 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  29.35 
 
 
391 aa  57  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  21.39 
 
 
378 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
260 aa  56.6  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  24.29 
 
 
417 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.87 
 
 
282 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.14 
 
 
396 aa  55.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.06 
 
 
212 aa  55.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  33.96 
 
 
229 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.46 
 
 
379 aa  55.5  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  29.57 
 
 
352 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  32 
 
 
213 aa  55.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  32.97 
 
 
390 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  23.98 
 
 
388 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  28.93 
 
 
495 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  24.62 
 
 
283 aa  54.7  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  23.4 
 
 
393 aa  54.7  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  28.18 
 
 
348 aa  54.3  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  25.93 
 
 
384 aa  54.3  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  24.8 
 
 
269 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  27.14 
 
 
209 aa  53.9  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  26.79 
 
 
270 aa  53.9  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  32.97 
 
 
388 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  37.76 
 
 
307 aa  53.5  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  27.91 
 
 
317 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  26.35 
 
 
389 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  22.95 
 
 
387 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  29.94 
 
 
212 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  28.57 
 
 
276 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  30.38 
 
 
185 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
388 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  33.72 
 
 
281 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  27.81 
 
 
381 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
214 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.79 
 
 
205 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  23.13 
 
 
386 aa  52  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  26.42 
 
 
378 aa  51.6  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  29.46 
 
 
252 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  26.57 
 
 
374 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  25.26 
 
 
371 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
211 aa  51.2  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  27.78 
 
 
202 aa  51.2  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  26.5 
 
 
241 aa  51.2  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.46 
 
 
400 aa  51.2  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>