More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2881 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  51.54 
 
 		 227 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  50.44 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  50.46 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  33.91 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  33.83 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  40.49 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  39.88 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  39.88 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  35.78 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  39.13 
 
 		 193 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.47 
 
 		 210 aa  95.1  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  34.3 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.68 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 209 aa  91.7  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.44 
 
 		 388 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  28.84 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  33.12 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.99 
 
 		 183 aa  88.6  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  33.5 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.66 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05380  Polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 334 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  32.76 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  30.48 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.41 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 208 aa  85.1  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  30.58 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.72 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  33.86 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  35.36 
 
 		 495 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  27.17 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  27.17 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  30.85 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  26.59 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  27.67 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  27.88 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.49 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  33.93 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  32.98 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  30.05 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 378 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  35.2 
 
 		 298 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  29.1 
 
 		 283 aa  72  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 431 aa  71.6  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.48 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.42 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  29.34 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  24.56 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.56 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.16 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.38 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  28.42 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.86 
 
 		 379 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  25.86 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.48 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.86 
 
 		 379 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  27.36 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.86 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.71 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.71 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.86 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.86 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.71 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.54 
 
 		 429 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.71 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>