More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0160 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  100 
 
 
208 aa  423  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  73.5 
 
 
212 aa  297  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  71.57 
 
 
207 aa  292  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  55.72 
 
 
208 aa  229  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  59.7 
 
 
210 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  55.56 
 
 
207 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  55.28 
 
 
211 aa  224  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  56.19 
 
 
209 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  57.14 
 
 
188 aa  221  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  59.69 
 
 
208 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  62.65 
 
 
209 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  61.45 
 
 
207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  50.78 
 
 
211 aa  207  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  56.08 
 
 
213 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  59.64 
 
 
183 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  46.8 
 
 
218 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  49.7 
 
 
215 aa  185  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  49.7 
 
 
216 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  43.46 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  45.24 
 
 
206 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  38.02 
 
 
202 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  41.09 
 
 
213 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  36.02 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.22 
 
 
205 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  30.89 
 
 
269 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  35.19 
 
 
193 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.75 
 
 
192 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.75 
 
 
192 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  34.16 
 
 
185 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.23 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  33.54 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  33.54 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
277 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  30.73 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  27.22 
 
 
205 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  34.12 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  32.1 
 
 
184 aa  89  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  34.52 
 
 
187 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.06 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.06 
 
 
379 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.06 
 
 
348 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.06 
 
 
348 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.06 
 
 
351 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
283 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  32.78 
 
 
282 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  29.65 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.73 
 
 
388 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  29.44 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.94 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.51 
 
 
277 aa  82  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  35.19 
 
 
282 aa  82  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  29.44 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
356 aa  79  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.16 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  30.35 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.36 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  30.96 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  30.96 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  32.18 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.49 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  29.65 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.81 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  33.14 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  44.44 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  30.36 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  27.46 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  28.71 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  29.15 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  32.26 
 
 
377 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  28.98 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  30.72 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  31.03 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  31.77 
 
 
378 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  30.18 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  27.5 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  28.49 
 
 
351 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  27.23 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  28.33 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  32.62 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  32.95 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  30.1 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  28.72 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  32.12 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  28.16 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  32.26 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>