More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2478 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  100 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  96.64 
 
 		 268 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  61.97 
 
 		 282 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  62.88 
 
 		 283 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  58.45 
 
 		 282 aa  345  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  50.6 
 
 		 269 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  47.64 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  46.07 
 
 		 281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  41.79 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  42.86 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  34.68 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 379 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.67 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 387 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.42 
 
 		 576 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  28.57 
 
 		 333 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 869 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 347 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  29.13 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  31.82 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.94 
 
 		 375 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1339  polysaccharide biosynthesis/export domain protein  27.8 
 
 		 377 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.06 
 
 		 378 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  28.44 
 
 		 386 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.63 
 
 		 373 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  30.65 
 
 		 897 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 834 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  31.12 
 
 		 833 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 823 aa  85.5  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.95 
 
 		 386 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  29.47 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  29.47 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.47 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.47 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  29.47 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  27.97 
 
 		 992 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  26.07 
 
 		 910 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.38 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  42.35 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.09 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 830 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 849 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 824 aa  79.7  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 828 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.34 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.34 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.34 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.96 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.34 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.34 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.34 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 753 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.34 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 352 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  28.41 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  28.2 
 
 		 379 aa  78.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.93 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.93 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.93 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.76 
 
 		 920 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.93 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  29 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.91 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.93 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.5 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 828 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.17 
 
 		 827 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28 
 
 		 1055 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  23.83 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 922 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 919 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>