More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1536 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  71.57 
 
 		 208 aa  292  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  66.83 
 
 		 212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  54.92 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  51.22 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  54.07 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  52.88 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  50.24 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  50.25 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  49.01 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  53.89 
 
 		 188 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  51.85 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  49.06 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  53.01 
 
 		 183 aa  184  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  45.81 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  44.29 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  47.25 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  45.6 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  41.92 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  39.44 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  40.72 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  40.29 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.57 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.95 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.05 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.05 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  35.68 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  32.72 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  30 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.76 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  29.74 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 356 aa  82  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  31.03 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.97 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.16 
 
 		 379 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.16 
 
 		 379 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.16 
 
 		 348 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.16 
 
 		 348 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 388 aa  78.2  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.16 
 
 		 351 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  32.32 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  31 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.71 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  27.22 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.41 
 
 		 277 aa  74.7  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  29.26 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  40.45 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.12 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.32 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.46 
 
 		 431 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  40.45 
 
 		 268 aa  72  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.59 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 351 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  26.78 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.52 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.27 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  34.27 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  27.75 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.42 
 
 		 384 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>