More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1487 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  43.33 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  43.33 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  42.16 
 
 
187 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  45.89 
 
 
221 aa  128  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  41.57 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  41.56 
 
 
208 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  39.6 
 
 
200 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  39.76 
 
 
196 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  38.38 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  37.3 
 
 
191 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  44.52 
 
 
189 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  39.46 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  41.1 
 
 
196 aa  117  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  39.04 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  41.1 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  42.47 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  37.93 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  41.78 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  39.04 
 
 
234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  34.24 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  38.93 
 
 
192 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  39.6 
 
 
192 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  39.6 
 
 
192 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  41.78 
 
 
220 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  38.36 
 
 
213 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  39.73 
 
 
247 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  34.62 
 
 
190 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  34.93 
 
 
235 aa  99  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  34.93 
 
 
235 aa  99  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.5 
 
 
152 aa  94.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  34.93 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.24 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  34.53 
 
 
455 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  34.53 
 
 
455 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  35.85 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  36.96 
 
 
419 aa  87  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  37.74 
 
 
439 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.16 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  30.05 
 
 
185 aa  84.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  34.69 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  34.93 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  37.5 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.22 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  31.94 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  32.07 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.86 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  44.86 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  34.25 
 
 
442 aa  78.6  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  36.15 
 
 
816 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  34.25 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  32.35 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  32.18 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  35.1 
 
 
177 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  34.51 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.9 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  28.95 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  29.52 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  40.4 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.18 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  42.42 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  31.4 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  34.48 
 
 
437 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  30.99 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  29.48 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.58 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  35.48 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  28.06 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.32 
 
 
446 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.32 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.21 
 
 
422 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  34.19 
 
 
452 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30.46 
 
 
384 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  34.29 
 
 
451 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  33.52 
 
 
372 aa  68.2  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  32.43 
 
 
415 aa  67.8  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  32.43 
 
 
415 aa  67.8  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  34.65 
 
 
415 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  31.9 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  30.73 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  29.31 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  33.83 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  32.34 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  34.4 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  31.03 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
391 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  34.43 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  43.33 
 
 
411 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  30.73 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.17 
 
 
473 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  32.11 
 
 
451 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  28.14 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  33.14 
 
 
478 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  33.1 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>