More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4031 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  63.3 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  63.21 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  50 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  55.09 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  47.2 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  45.02 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  43.78 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  51.5 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  45.77 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  51.5 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  50 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  49.7 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  43.9 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  48.52 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  40.87 
 
 		 211 aa  178  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  48.3 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  44.79 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  42.08 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  40.59 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  37.63 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  36.06 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.68 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.68 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.68 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.2 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  31.02 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  36.75 
 
 		 282 aa  88.2  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  31.64 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.77 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  30.56 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.77 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.77 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.77 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.77 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  33.13 
 
 		 269 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.53 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.33 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.74 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 392 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.67 
 
 		 377 aa  78.6  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 387 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 387 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.14 
 
 		 362 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.5 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  31.46 
 
 		 378 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.5 
 
 		 396 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.5 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.9 
 
 		 378 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  31.84 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  29.24 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.9 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2951  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  29.85 
 
 		 407 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2859  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 387 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 407 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  31.95 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.39 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.93 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  30.34 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.78 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>