More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2336 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  100 
 
 
215 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  74.88 
 
 
218 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  68.48 
 
 
216 aa  263  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  50.25 
 
 
208 aa  208  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  47.66 
 
 
213 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  48.08 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  48.83 
 
 
209 aa  191  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  47.32 
 
 
209 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  48.53 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  48.48 
 
 
208 aa  187  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  45.64 
 
 
208 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  50.6 
 
 
207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  45.05 
 
 
211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  49.11 
 
 
212 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  46.12 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  44.78 
 
 
207 aa  179  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  49.4 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  47.62 
 
 
188 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  40.78 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  40.59 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  38.05 
 
 
214 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  42.6 
 
 
202 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  36 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.2 
 
 
193 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.15 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.93 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.15 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.15 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  33.13 
 
 
184 aa  92  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  29.56 
 
 
229 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.53 
 
 
277 aa  85.1  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  34.86 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  27.37 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  29.72 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.45 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.45 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  31.33 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.45 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.45 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.45 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  30 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  36.05 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  31.43 
 
 
282 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  31.93 
 
 
379 aa  78.6  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  31.79 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  32.58 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.97 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  33.71 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.95 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  31.32 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  32.93 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.58 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  29.45 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  30.32 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  27.98 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  29.94 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.33 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  30.17 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  32.58 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.74 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  29.67 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  28.83 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  28.83 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  29.17 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.38 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.18 
 
 
391 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.18 
 
 
391 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.18 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  30.16 
 
 
356 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.52 
 
 
388 aa  71.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30.95 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.11 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  31.93 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  28.33 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  34.2 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.52 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  28.22 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  30.98 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  30.98 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.98 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  30.98 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.98 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  30.98 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.98 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  31.35 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
387 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  31.79 
 
 
378 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  31.46 
 
 
379 aa  68.6  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  34.42 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  26.73 
 
 
397 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  27.97 
 
 
333 aa  68.2  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>