More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2030 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  100 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  51.15 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  52.29 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  49.43 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  50.41 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  46.06 
 
 		 269 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  49.59 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  40.3 
 
 		 281 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  44.08 
 
 		 268 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  40.15 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  32.54 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.53 
 
 		 379 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  32.53 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 387 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  30.74 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 210 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  32.07 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  31.47 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  36.2 
 
 		 209 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  36.75 
 
 		 216 aa  99  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  35.88 
 
 		 208 aa  99  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  34.95 
 
 		 207 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 213 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 379 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  36.27 
 
 		 208 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 376 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 431 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.91 
 
 		 373 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  31.84 
 
 		 992 aa  93.2  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  36.2 
 
 		 209 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  32.16 
 
 		 188 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  36.05 
 
 		 215 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  34.3 
 
 		 218 aa  92  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.09 
 
 		 378 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.95 
 
 		 183 aa  89.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.99 
 
 		 378 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.48 
 
 		 379 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 377 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 378 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 1055 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  31.93 
 
 		 202 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1339  polysaccharide biosynthesis/export domain protein  28.96 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.47 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.12 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.19 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 992 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  28.84 
 
 		 830 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.69 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.69 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.28 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.69 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.28 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.69 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.69 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.28 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.5 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.28 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.28 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  32.72 
 
 		 213 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.58 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.56 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.56 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  36.14 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.56 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.44 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  25 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  29.79 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  31.63 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.02 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  27 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 193 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 833 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30 
 
 		 869 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>