More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2529 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  100 
 
 
208 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  61 
 
 
207 aa  249  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  55.67 
 
 
210 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  53.59 
 
 
208 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  61.11 
 
 
209 aa  235  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  57.79 
 
 
212 aa  235  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  57.71 
 
 
207 aa  235  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  63.47 
 
 
188 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  57.35 
 
 
208 aa  232  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  54.07 
 
 
207 aa  224  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  50 
 
 
211 aa  216  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  51.5 
 
 
211 aa  214  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  56.89 
 
 
183 aa  208  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  49.24 
 
 
213 aa  207  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  47.55 
 
 
209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  51.18 
 
 
215 aa  195  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  48.3 
 
 
216 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  40.1 
 
 
206 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  36 
 
 
202 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  39.89 
 
 
214 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  40.84 
 
 
213 aa  141  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.36 
 
 
193 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
192 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
192 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.07 
 
 
192 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.57 
 
 
205 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
356 aa  95.5  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  33.74 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  36.27 
 
 
282 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.68 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  31.49 
 
 
283 aa  92  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  32.58 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  32.32 
 
 
388 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  29.83 
 
 
282 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
282 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  32.93 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  30.41 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  26.87 
 
 
281 aa  84.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  32.3 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.58 
 
 
495 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.72 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.12 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.72 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.72 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  29.45 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.72 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.72 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  27.71 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.72 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  28.07 
 
 
277 aa  79  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  29.34 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  30.12 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.88 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  30 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  43.53 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  28.86 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  23.3 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.37 
 
 
373 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.18 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  29.88 
 
 
269 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  30.94 
 
 
379 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  28.49 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  31.61 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.49 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  28.38 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.25 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.19 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.53 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.36 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  25.82 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.6 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.34 
 
 
378 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  31.28 
 
 
393 aa  72  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.79 
 
 
495 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.79 
 
 
495 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.57 
 
 
396 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 
391 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 
391 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.57 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.49 
 
 
393 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
386 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.23 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  33.07 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  31.93 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.65 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>