More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1660 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  100 
 
 
214 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  50.49 
 
 
206 aa  207  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  45.02 
 
 
202 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  43.46 
 
 
208 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  39.44 
 
 
207 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  41.12 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  37.14 
 
 
218 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  41.95 
 
 
212 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  39.44 
 
 
208 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  38.31 
 
 
207 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  41.18 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  38.5 
 
 
188 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  37.5 
 
 
213 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  39.89 
 
 
208 aa  134  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  38.24 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.32 
 
 
211 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  35.45 
 
 
209 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  39.76 
 
 
207 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  39.52 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.76 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  35.29 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  36.89 
 
 
213 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  36.47 
 
 
193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  32.68 
 
 
192 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  32.68 
 
 
192 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.2 
 
 
192 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  35.98 
 
 
252 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.1 
 
 
205 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  33.82 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  36.2 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
205 aa  94.7  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  33.33 
 
 
269 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  28.84 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.34 
 
 
268 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  32.63 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30.95 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  34.29 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  31.48 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  30.86 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.16 
 
 
377 aa  78.6  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  33.71 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  36.3 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  30.25 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  30.25 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.76 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.86 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  31.84 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.26 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.26 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  29.79 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  31.55 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.26 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.26 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.26 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  24.4 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  29.89 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  29.63 
 
 
270 aa  72  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.22 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.86 
 
 
378 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  34.04 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  27.36 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  32.41 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  31.28 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  30.29 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  31.58 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.28 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  30.99 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  32.41 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  30.14 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  47.14 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  31.63 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  31.95 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.76 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  31.9 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  44.29 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  30.46 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  32.41 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  32.41 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  32.41 
 
 
387 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  32.26 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  27.64 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  31.28 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  32.26 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  32.14 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  30.73 
 
 
378 aa  68.6  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  31.28 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  32.14 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.03 
 
 
392 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.03 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>