More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2495 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  73.5 
 
 		 208 aa  297  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  66.83 
 
 		 207 aa  273  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  57.79 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  53.69 
 
 		 211 aa  221  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  55.28 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  51.78 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  52.79 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  55.85 
 
 		 188 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  59.64 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  54 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  51.67 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  52.5 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  59.04 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  48.06 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  49.11 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  51.48 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  48.52 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  42.19 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  38.89 
 
 		 202 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  41.95 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  37.69 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.23 
 
 		 379 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.23 
 
 		 379 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.23 
 
 		 351 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.23 
 
 		 348 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.23 
 
 		 348 aa  92  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 277 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.43 
 
 		 379 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.11 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  32.29 
 
 		 282 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.34 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  29.78 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  30.35 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  30.23 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  28 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  33.33 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  34.15 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  32.95 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  32.18 
 
 		 377 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.48 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.03 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  31.93 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 431 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  31.14 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  29.15 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  27.71 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  43.33 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  26.5 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.37 
 
 		 379 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.21 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  34.48 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 376 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>