More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1170 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  69.95 
 
 		 183 aa  278  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  60 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  48.51 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  49.29 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  50 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  50.78 
 
 		 208 aa  207  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  48.06 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  44.65 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  53.29 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  45.64 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  44.9 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  45.81 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  49.7 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  43.15 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  44.22 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  46.77 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  43.16 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  39.71 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  39.6 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  35.71 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  32.57 
 
 		 373 aa  91.7  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.98 
 
 		 379 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.77 
 
 		 351 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.77 
 
 		 348 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 379 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.77 
 
 		 348 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.98 
 
 		 379 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  32.66 
 
 		 317 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  28.78 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 379 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 378 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  31.22 
 
 		 378 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 388 aa  85.5  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  34.52 
 
 		 277 aa  85.5  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.23 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  26.73 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  26.73 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 270 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.41 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.43 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  31.89 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  31.89 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.89 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  31.89 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.89 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.89 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  31.89 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  28.97 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  31.98 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.7 
 
 		 362 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.81 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 495 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  31.32 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 368 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  30.86 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 368 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.78 
 
 		 431 aa  75.1  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  30.98 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  28.48 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.9 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  27 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  30.51 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  31.64 
 
 		 282 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.3 
 
 		 277 aa  72  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 351 aa  71.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  25.65 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  33.15 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  28.92 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.5 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  30.3 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>