More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2475 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  65.37 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  67.49 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  58.66 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  60.15 
 
 		 268 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  49.43 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  44.07 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  42.42 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  40.07 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  39.47 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  31.68 
 
 		 362 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  31.66 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.62 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 869 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 347 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  31.84 
 
 		 209 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.36 
 
 		 576 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.07 
 
 		 210 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  41.44 
 
 		 192 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  41.44 
 
 		 192 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  41.44 
 
 		 192 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 1055 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  25.29 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.76 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 208 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  28.45 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  28.45 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.45 
 
 		 386 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.45 
 
 		 386 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.45 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.03 
 
 		 386 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.24 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.92 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  26.12 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 992 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  25.18 
 
 		 753 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.57 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.46 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  29.14 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.2 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  26.46 
 
 		 823 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  28.45 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.05 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 852 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.05 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.62 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25 
 
 		 897 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.65 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.65 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.65 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.65 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.65 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  32 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 910 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  24.89 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.38 
 
 		 781 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  26.69 
 
 		 992 aa  77.4  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 830 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  25.65 
 
 		 947 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 834 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  24.21 
 
 		 828 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  28.62 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  39.56 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 846 aa  75.5  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  29.83 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  41.88 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.11 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 833 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  47.89 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>