More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0660 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  100 
 
 		 823 aa  1608    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  43.25 
 
 		 1070 aa  573  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 992 aa  226  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  28.62 
 
 		 992 aa  225  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1613  polysaccharide export protein  24.94 
 
 		 830 aa  134  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 268 aa  93.2  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.58 
 
 		 431 aa  92.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  26.86 
 
 		 269 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  30.28 
 
 		 381 aa  89  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 386 aa  87  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.72 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  26.85 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  28.64 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  26.61 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  29.57 
 
 		 282 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  28.12 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.67 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.92 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  27.65 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  28.37 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  24.62 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.25 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.25 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.89 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.25 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.25 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.89 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.25 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.89 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  24.34 
 
 		 333 aa  80.5  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 388 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 392 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  23.43 
 
 		 473 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 392 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.89 
 
 		 396 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 379 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  23.97 
 
 		 379 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  25 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.89 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  23.28 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.04 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.4 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.54 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.54 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  26.98 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.91 
 
 		 375 aa  77  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.54 
 
 		 422 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  28.37 
 
 		 936 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.1 
 
 		 352 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  24.77 
 
 		 391 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  24.25 
 
 		 268 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  25.7 
 
 		 384 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  24.35 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  26.82 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  28.17 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  33.33 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  25.61 
 
 		 268 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.2 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 282 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.29 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.54 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.2 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.02 
 
 		 869 aa  73.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  23 
 
 		 374 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.4 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  23.5 
 
 		 803 aa  73.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 977 aa  72  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 833 aa  72  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 385 aa  72  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 281 aa  72  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  22.9 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  30.06 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>