More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22210 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  100 
 
 
295 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  30.91 
 
 
277 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  30.5 
 
 
992 aa  99.8  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.15 
 
 
378 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.15 
 
 
378 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.8 
 
 
379 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
379 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
379 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.8 
 
 
379 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.8 
 
 
379 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.15 
 
 
386 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.8 
 
 
386 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.8 
 
 
386 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25.77 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  26.02 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.03 
 
 
373 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.08 
 
 
396 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.08 
 
 
396 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  27.94 
 
 
333 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.3 
 
 
379 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.08 
 
 
391 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  25 
 
 
378 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.08 
 
 
391 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  24.57 
 
 
377 aa  85.9  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.25 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.16 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  28.04 
 
 
992 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.09 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  27.67 
 
 
390 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  28.1 
 
 
397 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.09 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.09 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28.8 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.09 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.09 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.09 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.66 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  26.87 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.69 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.69 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.69 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  25.68 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  26.4 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  24.73 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  25.17 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.17 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  24.44 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  25 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  27.69 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  25.34 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  25.85 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  26.39 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  26.03 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  27.05 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  24.3 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  26.62 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  22.37 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  23.84 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.31 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  26.44 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  26.89 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.25 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.83 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  25.68 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.83 
 
 
446 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  27.92 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  25 
 
 
426 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  23.25 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  27.46 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.86 
 
 
392 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  25.34 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.86 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  26.3 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  23.02 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  25.67 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.1 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.43 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  26.35 
 
 
700 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  24.66 
 
 
426 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  24.49 
 
 
495 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  25.75 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  23.91 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  23.97 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  27.83 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.09 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  24.23 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  22.86 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  24.19 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.37 
 
 
495 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  25.77 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
580 aa  69.7  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>