More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0290 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  92.04 
 
 		 992 aa  1822    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  100 
 
 		 992 aa  1959    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 1070 aa  297  6e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  28.62 
 
 		 823 aa  225  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1613  polysaccharide export protein  21.99 
 
 		 830 aa  124  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  27.7 
 
 		 478 aa  110  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.39 
 
 		 830 aa  110  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 947 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 948 aa  102  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 281 aa  101  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 1055 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  26.1 
 
 		 823 aa  99.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 936 aa  97.8  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  25.4 
 
 		 828 aa  97.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  31.66 
 
 		 264 aa  96.3  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  26.51 
 
 		 952 aa  94.7  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 828 aa  94.4  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 580 aa  94  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 834 aa  94.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 833 aa  93.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.56 
 
 		 781 aa  92.8  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 824 aa  92.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  22.67 
 
 		 827 aa  91.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  29.62 
 
 		 295 aa  91.3  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 830 aa  91.3  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2030  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 282 aa  90.1  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.440027  normal  0.0564831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.28 
 
 		 396 aa  89.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  29.54 
 
 		 282 aa  89.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  25.41 
 
 		 940 aa  88.2  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  28.62 
 
 		 282 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  27.9 
 
 		 371 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  33.5 
 
 		 347 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.44 
 
 		 846 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.48 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  30 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  24.85 
 
 		 828 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  30 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  28.19 
 
 		 268 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  22.96 
 
 		 869 aa  83.2  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  27.99 
 
 		 283 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  29.41 
 
 		 268 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  28.1 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.59 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.59 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.59 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.59 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 392 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  28.46 
 
 		 264 aa  80.1  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 392 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.12 
 
 		 352 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 392 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 753 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 912 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.15 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0830  capsular polysaccharide transport protein  29.51 
 
 		 269 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.738185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  24.23 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 920 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.72 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  24.08 
 
 		 837 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  24.08 
 
 		 837 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.52 
 
 		 920 aa  78.2  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  23.83 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25 
 
 		 919 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 915 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  24.6 
 
 		 837 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 919 aa  77  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  27.74 
 
 		 700 aa  77  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  22.31 
 
 		 977 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  25 
 
 		 833 aa  76.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 910 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  24.02 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.1 
 
 		 703 aa  75.5  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  26.57 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.83 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  26.94 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.74 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.85 
 
 		 393 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  26.02 
 
 		 362 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 348 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.95 
 
 		 429 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>