More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3319 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  100 
 
 		 351 aa  707    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  49.07 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  32.88 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  34.93 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  33.91 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  38 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  34.65 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  32.56 
 
 		 324 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  32.83 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  31.64 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  29.96 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  32.95 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  26.67 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 264 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.55 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  29.71 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29 
 
 		 781 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  36.14 
 
 		 206 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  27.8 
 
 		 262 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.94 
 
 		 243 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 803 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.91 
 
 		 897 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 492 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 495 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.76 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 852 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 508 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  33.91 
 
 		 205 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  35.39 
 
 		 270 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 208 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  24.62 
 
 		 919 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.92 
 
 		 473 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.99 
 
 		 920 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  27.56 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4112  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 216 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  33.94 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  26.3 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  24.58 
 
 		 910 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  26.87 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 824 aa  80.1  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  24.7 
 
 		 948 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  25.63 
 
 		 1055 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  24.5 
 
 		 920 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  32.94 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.2 
 
 		 833 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  27.83 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25.63 
 
 		 931 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  24.36 
 
 		 823 aa  77.4  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.87 
 
 		 828 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 869 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 828 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  27.51 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 580 aa  75.9  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.24 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  26.94 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.39 
 
 		 551 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  23.97 
 
 		 940 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  25.96 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.91 
 
 		 922 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.97 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  25.53 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  24.12 
 
 		 936 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  24.92 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 833 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.28 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  32 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 205 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.96 
 
 		 576 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  28.41 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  25.24 
 
 		 919 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 921 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.85 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  26.1 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>