More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1013 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4235  polysaccharide export protein  36.92 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.694304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  34.46 
 
 		 252 aa  99  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  33.14 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 208 aa  84.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.4 
 
 		 920 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  31.63 
 
 		 580 aa  80.1  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1170  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  32.95 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28.8 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  30.36 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.46 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.48 
 
 		 833 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 931 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.98 
 
 		 915 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  29.68 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.02 
 
 		 834 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  33.89 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 779 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  30.18 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 753 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 379 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 849 aa  71.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 828 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  25 
 
 		 922 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.07 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.07 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  28.78 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.93 
 
 		 910 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 920 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  25 
 
 		 828 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02599  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.16 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.357236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.52 
 
 		 948 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  27.81 
 
 		 803 aa  68.6  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.72 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.21 
 
 		 827 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  29.71 
 
 		 992 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2397  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232374  normal  0.762704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.4 
 
 		 919 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.49 
 
 		 877 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0281  polysaccharide export outer membrane protein  27.06 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  0.906054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  26.16 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  32.09 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  25.58 
 
 		 921 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 216 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 919 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  31.38 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  34.12 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.9 
 
 		 800 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 936 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.9 
 
 		 875 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  34.07 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  31.69 
 
 		 952 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.52 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.12 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  27.17 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  25.27 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  25.28 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  29.1 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.41 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 389 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  25 
 
 		 828 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  28.27 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 298 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.73 
 
 		 877 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.05 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 830 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>