More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0810 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  47.37 
 
 		 153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  41.95 
 
 		 178 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  43.33 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  42.38 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  42.11 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.46 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  40.76 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.33 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.91 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  33.88 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  37.75 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  33.92 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  32.97 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  34.57 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  34.57 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  34.57 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  33.12 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  40.91 
 
 		 419 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 191 aa  91.3  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  34.87 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  34.87 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 192 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  33.54 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  32.24 
 
 		 238 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  37.9 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 235 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 235 aa  87.4  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 213 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 220 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  30.87 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  32.07 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.44 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  35.81 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  31.17 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 429 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 816 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  36.07 
 
 		 441 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 425 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  30.15 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  38.81 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.9 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  38.81 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  30.13 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  34.04 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 237 aa  74.7  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  38.94 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  32.61 
 
 		 276 aa  74.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  41.35 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  31.44 
 
 		 232 aa  72  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  25.99 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  33.95 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  40.71 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 446 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.92 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  34.75 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  31.08 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 422 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  36.79 
 
 		 823 aa  69.3  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  33.07 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 437 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  27.64 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>