More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0791 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  48.39 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  47.74 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  48.85 
 
 
196 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  46.11 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  45.81 
 
 
189 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  46.3 
 
 
219 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  42.93 
 
 
186 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  44.86 
 
 
187 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  48.43 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  46.58 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  44.26 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  47.71 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  44.26 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  45.34 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  47.53 
 
 
220 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  40.98 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  47.71 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  39.34 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  42.61 
 
 
196 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  45.39 
 
 
195 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  41.56 
 
 
200 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  45.7 
 
 
247 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  45.39 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  44.81 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  41.83 
 
 
175 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  40.82 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  36.13 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  37.95 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  47.4 
 
 
190 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  44.07 
 
 
190 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  40.91 
 
 
153 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.18 
 
 
177 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  35.06 
 
 
178 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.98 
 
 
178 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  34.16 
 
 
437 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  36.36 
 
 
184 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.6 
 
 
185 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  42.03 
 
 
417 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  39.84 
 
 
435 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  33.53 
 
 
427 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.06 
 
 
152 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.66 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  39.47 
 
 
419 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  42.37 
 
 
422 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  40.68 
 
 
426 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  31.82 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  40.74 
 
 
415 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  42.28 
 
 
264 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  34.84 
 
 
455 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  34.84 
 
 
455 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  34.73 
 
 
252 aa  85.1  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  36.42 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.47 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.78 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  37.93 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  39 
 
 
434 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  34.93 
 
 
816 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.37 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  39.25 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.24 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  39.25 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  35 
 
 
439 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  39.5 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  40.66 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  41.75 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.28 
 
 
431 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  38.89 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  31.21 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  32.8 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  29.35 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  38.02 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  29.45 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  42.86 
 
 
461 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.71 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  41.49 
 
 
442 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  35.2 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.11 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.11 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  33.77 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  34.31 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  33.77 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  31.75 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  36.81 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  34.48 
 
 
423 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  31.03 
 
 
209 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.45 
 
 
192 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0658  polysaccharide export protein  28.95 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  29.05 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  36.64 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  30.56 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  36.84 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  33.14 
 
 
441 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  32.14 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>