More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1224 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  96.86 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  74.07 
 
 		 189 aa  291  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  70 
 
 		 191 aa  277  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  69.02 
 
 		 195 aa  269  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  69.02 
 
 		 196 aa  269  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  67.76 
 
 		 187 aa  265  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  69.59 
 
 		 196 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  45.6 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  50.67 
 
 		 213 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  42.58 
 
 		 220 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  50.67 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  46.67 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  48.67 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  45.27 
 
 		 247 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  46.63 
 
 		 235 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  46.63 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  44.09 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  43.68 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  48 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  48 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  47.33 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  43.55 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  48 
 
 		 221 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  40.32 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  43.04 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  40.98 
 
 		 216 aa  127  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  42.02 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  37.3 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  40.13 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  32.64 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  38.41 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  34.84 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.67 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  36 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  32.03 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  30.63 
 
 		 177 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  33.76 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  37.96 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.23 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.33 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  39.66 
 
 		 419 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  38.46 
 
 		 442 aa  84.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  35.29 
 
 		 426 aa  84.3  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  32.88 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 422 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  32.19 
 
 		 455 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 439 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  36.64 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  31.4 
 
 		 435 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.21 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  32.2 
 
 		 437 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  29.35 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  32.1 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  37.96 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  40 
 
 		 816 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  34.25 
 
 		 461 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  37.74 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  37.74 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.69 
 
 		 396 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  34.11 
 
 		 252 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.48 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  31.54 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.33 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  38.14 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  38.14 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 495 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  31.52 
 
 		 495 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 257 aa  72  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 369 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.41 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.41 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  36.44 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  32.47 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.77 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  32.43 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  35.59 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  31.3 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  37.41 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>