More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2515 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  100 
 
 
429 aa  863    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  99.77 
 
 
429 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  96.97 
 
 
429 aa  817    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  100 
 
 
429 aa  863    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  100 
 
 
429 aa  863    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  99.77 
 
 
429 aa  862    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  99.77 
 
 
429 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  100 
 
 
429 aa  863    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  46.05 
 
 
396 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  45.8 
 
 
396 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  46.12 
 
 
391 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  46.12 
 
 
391 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  42.76 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  42.76 
 
 
392 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  42.76 
 
 
387 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  42.76 
 
 
387 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  43.71 
 
 
393 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  42.26 
 
 
392 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  42.73 
 
 
397 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  42.03 
 
 
392 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  42.25 
 
 
407 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  40.9 
 
 
407 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  35.46 
 
 
431 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  36.25 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  34.64 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  36.25 
 
 
368 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  36.01 
 
 
368 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  34.9 
 
 
317 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  35.61 
 
 
376 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  34.48 
 
 
379 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  32.93 
 
 
378 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  32.85 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.1 
 
 
386 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
377 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  32.62 
 
 
379 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.51 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  32.86 
 
 
379 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  32.86 
 
 
379 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  32.86 
 
 
379 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.86 
 
 
386 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.86 
 
 
379 aa  200  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.86 
 
 
386 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.47 
 
 
379 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.47 
 
 
379 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  32.63 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  31.64 
 
 
378 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  34.16 
 
 
381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.22 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  33.65 
 
 
393 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  33.17 
 
 
379 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
379 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.39 
 
 
348 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.39 
 
 
348 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.39 
 
 
351 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  32.85 
 
 
391 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  30.94 
 
 
391 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  31.59 
 
 
378 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  30.98 
 
 
387 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  34.83 
 
 
392 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  30.18 
 
 
426 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  30.37 
 
 
426 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.1 
 
 
396 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
378 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  32.69 
 
 
379 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  28.61 
 
 
371 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  33.23 
 
 
369 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  30.86 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  29.72 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  32.01 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  35.17 
 
 
356 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.24 
 
 
400 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.61 
 
 
446 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 
422 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  33.72 
 
 
352 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  31.05 
 
 
390 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  32.59 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30.35 
 
 
384 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  30.61 
 
 
390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  31.37 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  30.55 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  31.4 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  29.22 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  30.23 
 
 
384 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  31.37 
 
 
407 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  31.46 
 
 
428 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  31.57 
 
 
385 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  30.55 
 
 
390 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  35.04 
 
 
360 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>