More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3013 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  39.76 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  42.94 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  41.88 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  41.36 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  38.07 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  33.91 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  32.77 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  37.85 
 
 		 356 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  41.94 
 
 		 298 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 205 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  32.42 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 192 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  44.74 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  42.98 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 193 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  33.86 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  39.67 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.1 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  32.11 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  32.6 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 206 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  34.75 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  35.12 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.17 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  28.77 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 830 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  38.33 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  31.52 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  34.92 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  35.9 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  31.95 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  30.28 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  33.6 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  28.86 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  35.51 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.37 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  29.88 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.73 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  31.03 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  27.76 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 508 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  34.56 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  24.67 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  32.33 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  24.67 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  26.82 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 824 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  30.54 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  27.5 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  25.79 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  28.21 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.37 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  29.56 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 196 aa  62  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  29.32 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  27.36 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  26.16 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  27.93 
 
 		 1055 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>