More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1959 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  41.4 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 227 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  32.66 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 229 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 922 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 1055 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  30.49 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 919 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  28.22 
 
 		 492 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 387 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 931 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  30.41 
 
 		 897 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 912 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  25.85 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.75 
 
 		 919 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 		 921 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  26.01 
 
 		 920 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.58 
 
 		 910 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.16 
 
 		 915 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  25.31 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  23.3 
 
 		 869 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 852 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 828 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.16 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 828 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  26.79 
 
 		 869 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  27.31 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.53 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.53 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.53 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 940 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  25 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  29.09 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.07 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  24.1 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  29.22 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  28.92 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  29.22 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  30.06 
 
 		 781 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 936 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 869 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.11 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 837 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 837 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3531  lipoprotein PslD  23.5 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717769  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  28.77 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  25.93 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  39.17 
 
 		 419 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 185 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 837 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  26.01 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3303  polysaccharide export protein  23.88 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0200741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  28.32 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  24.85 
 
 		 948 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 977 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 833 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.31 
 
 		 920 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.33 
 
 		 834 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.18 
 
 		 877 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 823 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  25.87 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1339  polysaccharide biosynthesis/export domain protein  26.34 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  23.41 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  25.86 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.18 
 
 		 875 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>