More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1665 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  73.54 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  74.07 
 
 		 191 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  68.98 
 
 		 191 aa  276  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  69.59 
 
 		 196 aa  257  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  64.13 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  66.12 
 
 		 195 aa  254  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  66.12 
 
 		 196 aa  254  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  52 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  51.92 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  49.33 
 
 		 219 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  48.48 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  52.67 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  50.99 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  48.99 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  49.33 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  50.67 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  48.37 
 
 		 235 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  42.41 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  47.33 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  47.33 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  46.67 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  45.81 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  45.33 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  47.37 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  42.33 
 
 		 196 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  41.88 
 
 		 208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  38.82 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  35.14 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  44.52 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  34.24 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  39.74 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  37.08 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  37.33 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  38.67 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.89 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.67 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  32.58 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  36.21 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  39.26 
 
 		 419 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  29.51 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.38 
 
 		 232 aa  94.4  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 455 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 455 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  39.42 
 
 		 439 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  37.59 
 
 		 417 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  35.25 
 
 		 435 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  43.75 
 
 		 442 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  36.09 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  37.5 
 
 		 365 aa  81.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  35 
 
 		 249 aa  81.3  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  36.13 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  35.11 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  34.38 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  32.47 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.96 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 422 aa  78.6  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  33.12 
 
 		 367 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  32.48 
 
 		 384 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  35.85 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  32.48 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  31.65 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  38.17 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  29.5 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  40.91 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  35.19 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.85 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  34.17 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  37.3 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.85 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  31.95 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  30.94 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 243 aa  72  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  39.09 
 
 		 816 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  35.2 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  31.91 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  37.17 
 
 		 451 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  39.56 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.12 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  34.59 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  45.05 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.12 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  34.17 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  36.43 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  34.42 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  33.13 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 417 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  34.25 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>