More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05205 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  359  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  83.62 
 
 		 177 aa  305  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  46.5 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  43.33 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  45.33 
 
 		 193 aa  148  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  41.67 
 
 		 185 aa  147  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  40.78 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  45.7 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  46.2 
 
 		 177 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  41.14 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  42.86 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.33 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  35.58 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  35.58 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  33.74 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  35.26 
 
 		 213 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  34.36 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  34.39 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 235 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 234 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  32.05 
 
 		 235 aa  101  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  34.23 
 
 		 247 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 221 aa  95.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 200 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  35.53 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 192 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  34.21 
 
 		 192 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  34.87 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 208 aa  87.8  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  30.05 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  35.87 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  32.89 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  32.89 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 455 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 455 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  34.13 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  30.97 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.71 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  35.85 
 
 		 439 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 377 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 379 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 441 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  32.68 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  32.68 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  32.68 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  32.68 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.68 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.68 
 
 		 386 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.68 
 
 		 386 aa  70.9  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.2 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  25.45 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  29.94 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  33.33 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.94 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  40.23 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  30.38 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 419 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.46 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  30.11 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  30.41 
 
 		 379 aa  64.7  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  37.93 
 
 		 410 aa  64.7  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>