More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1156 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  74.19 
 
 		 195 aa  294  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  74.19 
 
 		 196 aa  294  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  76.61 
 
 		 196 aa  287  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  68.85 
 
 		 191 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  67.76 
 
 		 191 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  63.98 
 
 		 191 aa  255  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  64.13 
 
 		 189 aa  255  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  55.56 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  53.33 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  54.04 
 
 		 238 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  54.67 
 
 		 213 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  46.6 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  53.33 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  52.67 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  54.67 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  54 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  50.68 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  48.65 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  54 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  52.98 
 
 		 235 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  52.94 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  48.11 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  43.23 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  46.1 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  44.86 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  42.16 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  46.67 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  43.33 
 
 		 153 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  43.65 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  41.45 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  39.55 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  38.67 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  42.38 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  34.81 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  38.75 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.71 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  34.16 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.75 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  33.33 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.33 
 
 		 152 aa  99.4  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.95 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.33 
 
 		 232 aa  91.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  34.52 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  39.25 
 
 		 419 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  37.8 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 455 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  35 
 
 		 455 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  34.88 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  36.29 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  42.59 
 
 		 816 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  37.3 
 
 		 427 aa  78.6  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  37.98 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  37.74 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  38.52 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  37.74 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.38 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  30.59 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  34.53 
 
 		 365 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  32.9 
 
 		 442 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  32.84 
 
 		 437 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  32.67 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  33.9 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  35.78 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  30.64 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28.23 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  35.46 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  33.33 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 384 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 454 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  30.14 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.24 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  38.81 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.47 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  34.82 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  32 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  35.07 
 
 		 495 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  35.07 
 
 		 495 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3282  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  29.59 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.306881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  36.07 
 
 		 411 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  28 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>