More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3370 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  80.24 
 
 
415 aa  670    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  80 
 
 
415 aa  668    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  100 
 
 
415 aa  837    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  29.63 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  28.27 
 
 
436 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  27.38 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  30.69 
 
 
442 aa  126  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  26.33 
 
 
434 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  26.25 
 
 
452 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  28.54 
 
 
411 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  27.41 
 
 
410 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  27.41 
 
 
410 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  26.58 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  25.47 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  26.39 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  26.3 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  25.76 
 
 
426 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  26.02 
 
 
423 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  25.94 
 
 
425 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  25.65 
 
 
441 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  25.78 
 
 
451 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  26.4 
 
 
441 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  23.89 
 
 
437 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
439 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  25.88 
 
 
455 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  25.88 
 
 
455 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  26.17 
 
 
417 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  26.41 
 
 
435 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  25 
 
 
451 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  40.74 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  41.07 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  23.43 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  25.06 
 
 
816 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  37.23 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  41.67 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
529 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  40.18 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.63 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  34.31 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  37.04 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  34.31 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  39.25 
 
 
238 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  37.04 
 
 
191 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.79 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  34.35 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  37.96 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  38.68 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  25 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  35.19 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  35.4 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  35.85 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  31.16 
 
 
185 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  37.89 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  33.07 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  36.11 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35.85 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  34.78 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  34.78 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  37.38 
 
 
213 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  28.97 
 
 
185 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  34.78 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  32.14 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  36.36 
 
 
196 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  34.58 
 
 
193 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  29.58 
 
 
185 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  38.79 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.65 
 
 
193 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.02 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
186 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  34.26 
 
 
177 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  34.55 
 
 
252 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  34.26 
 
 
195 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  36.79 
 
 
220 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  22.66 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  33.33 
 
 
268 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  35.24 
 
 
247 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  30.19 
 
 
221 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30 
 
 
193 aa  63.9  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  36.61 
 
 
206 aa  63.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  36.89 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  32.87 
 
 
210 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
190 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.06 
 
 
277 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  33.04 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  33.04 
 
 
192 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.61 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  34.78 
 
 
277 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.09 
 
 
152 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  33.04 
 
 
192 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
237 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  34.82 
 
 
347 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.69 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  26.42 
 
 
200 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  35.78 
 
 
190 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  36.79 
 
 
333 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  28.24 
 
 
192 aa  59.7  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  33.09 
 
 
454 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  27.67 
 
 
218 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  32.73 
 
 
208 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  25.63 
 
 
501 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>