168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5937 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  100 
 
 		 426 aa  853    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  67.1 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  45.09 
 
 		 427 aa  332  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  33.42 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  33.07 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  31.99 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  31.13 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  31.13 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  32.62 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 438 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  27.48 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  25.76 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  25.38 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  25.13 
 
 		 415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  25.69 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  37.6 
 
 		 196 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 216 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  40.83 
 
 		 238 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  37.97 
 
 		 175 aa  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  37.19 
 
 		 219 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  37.82 
 
 		 213 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  36.3 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  35.48 
 
 		 195 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  26.35 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  37.18 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  35.43 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  39.17 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  36.29 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  25.3 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  24.87 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  24.69 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  41.38 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  37.21 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 196 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  36.89 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  25.8 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  35.04 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  30.13 
 
 		 185 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 816 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  32.28 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  33.56 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  33.56 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  34.72 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  42.42 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  22.65 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 192 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  23.06 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.82 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  31.5 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  23.81 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 190 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  22.93 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  38 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 478 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 184 aa  67  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  41.46 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  35.07 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.56 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  33.33 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  22.47 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  37.36 
 
 		 192 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  23.17 
 
 		 501 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 243 aa  57  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.09 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.09 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.23 
 
 		 193 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  32.09 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  32.09 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  32.09 
 
 		 379 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  29.17 
 
 		 177 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31.34 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.77 
 
 		 277 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  25.89 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  29.46 
 
 		 177 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.57 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  32.17 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>