174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3695 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  100 
 
 		 441 aa  863    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  30 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  25.65 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  27.3 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  27.03 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  27.22 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  26.3 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  29.26 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  23.88 
 
 		 816 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  36.03 
 
 		 178 aa  87.4  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  26.06 
 
 		 461 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  27.76 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  27.86 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  41.75 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  36.94 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  39.81 
 
 		 178 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  27.34 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.81 
 
 		 152 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  35.61 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  41.75 
 
 		 153 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  35 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  29.18 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  29.18 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  35 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  35.34 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 185 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 191 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  36.36 
 
 		 177 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 191 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  38.85 
 
 		 221 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.09 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  36.11 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  40.71 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  23.61 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  24.19 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 177 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  34.11 
 
 		 192 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  36.61 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  38.1 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  40.2 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  36.04 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 247 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  43.48 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  36.89 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  37.14 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 185 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  26.82 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  26.15 
 
 		 192 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  35.58 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  40.22 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  39.13 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  26.58 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  31.54 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  33.78 
 
 		 201 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  36.96 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  36.56 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  33.96 
 
 		 268 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.29 
 
 		 249 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 186 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.71 
 
 		 264 aa  53.5  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  34.17 
 
 		 253 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  38.05 
 
 		 940 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 185 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  32.79 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  36.56 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  33.07 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>