More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1588 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  63.91 
 
 		 253 aa  301  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  37.02 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  38.97 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  39.49 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  38.97 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  38.79 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  32.63 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  38.21 
 
 		 177 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  41.67 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  41.67 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  41.67 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  42.4 
 
 		 193 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  39.45 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  33.93 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.08 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  34.09 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  37.1 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  34.09 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  33.33 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 191 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.4 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  38.52 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  33.15 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  27.18 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  36.43 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  35.94 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  32 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  32 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  35.48 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  32.2 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  37.17 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  37.29 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  31.14 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  35.65 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  34.35 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  38.56 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  32 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  32.81 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  25.21 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  33.59 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  38.78 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  30.98 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  30.54 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2336  polysaccharide export protein  34.55 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.125477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  34.13 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  30 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  35.94 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  29.82 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  32.08 
 
 		 877 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  28.91 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  36.21 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  32.33 
 
 		 307 aa  62  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 185 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 185 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 185 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  30.29 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2021  polysaccharide export protein  34.09 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  29.41 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  27.82 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  31.45 
 
 		 875 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  32.17 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.45 
 
 		 800 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  35.16 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  29.01 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  35.19 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  35.09 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>