283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6397 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  55.12 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  56.57 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  45.71 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  42.21 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  37.64 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  40.32 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  36.58 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  40.72 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  36.33 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  36.82 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  38.03 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  32.17 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  31.78 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  30.12 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  31.53 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  26.58 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  36.09 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.9 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.87 
 
 		 431 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  33.82 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  32.3 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  29.74 
 
 		 391 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  30.3 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.94 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  27.27 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.94 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.49 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.94 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  35.92 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  33.1 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.94 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.94 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.88 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.88 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.88 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.88 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.35 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  33.65 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  30.87 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  28.26 
 
 		 362 aa  62  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.79 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  27.7 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.96 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  29.01 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  25.5 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.02 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.02 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.02 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.02 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.02 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.86 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.02 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  25.27 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  28.87 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  32.86 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 391 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.5 
 
 		 400 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  27.32 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 478 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>