258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0437 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  100 
 
 
307 aa  626  1e-178  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  43.91 
 
 
260 aa  195  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  40 
 
 
263 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  37.92 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  37 
 
 
283 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  36.74 
 
 
281 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  38.03 
 
 
265 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  37.65 
 
 
275 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  39.73 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  33.21 
 
 
276 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  33.19 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  33.94 
 
 
276 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  34.4 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  31.37 
 
 
250 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  32.2 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  33.33 
 
 
257 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  25.58 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  35.26 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  33.12 
 
 
379 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  33.12 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  34.1 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  25.63 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  37.66 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.13 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  35.98 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  27.98 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.95 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  29.44 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  35.24 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.89 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  28.81 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  25.42 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.09 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  32.16 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.69 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  28.45 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.69 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.69 
 
 
422 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.09 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  35.66 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  37.72 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  30.24 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  30.52 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  26.92 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  26.57 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  31.44 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  31.21 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  32.66 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  28.96 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  33.81 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  31.79 
 
 
426 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  34.23 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  31.22 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.5 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  26.64 
 
 
196 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  25.74 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  30 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  30.57 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
390 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.91 
 
 
429 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  35.24 
 
 
193 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  26.59 
 
 
390 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.27 
 
 
398 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  31.11 
 
 
234 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  32.64 
 
 
388 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  29.13 
 
 
384 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  32.33 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  32.68 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  32.43 
 
 
187 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
216 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  31.73 
 
 
208 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  32.08 
 
 
191 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  29.75 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  25.81 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  29.05 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  31.28 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  29.41 
 
 
408 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  32.08 
 
 
191 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  30.06 
 
 
392 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  32.14 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  29.12 
 
 
431 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  29.41 
 
 
407 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  31.18 
 
 
428 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  35.21 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  28.72 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  30.06 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>