More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4285 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4285  polysaccharide export protein  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0419531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3007  exopolysaccharide transporter  63.4 
 
 		 256 aa  321  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3303  polysaccharide export protein  61.73 
 
 		 259 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0200741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3531  lipoprotein PslD  60.83 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.717769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  32.21 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  37.86 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.41 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  36.23 
 
 		 393 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.93 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.93 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.25 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.81 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  38.3 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  38.3 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  38.3 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  38.3 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  35.51 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  33.81 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  32.54 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  36.99 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.08 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.08 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.08 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.08 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.08 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  34.27 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  34.08 
 
 		 379 aa  72  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  33.57 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  36.23 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 379 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  34.08 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  33.09 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  34.84 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.84 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.09 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.84 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.84 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  34.84 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  36.96 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.84 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  33.09 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.84 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.09 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.09 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  33.09 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  33.09 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 869 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  30.57 
 
 		 191 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 379 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 919 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  32.95 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  31.11 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  27.57 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.55 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1959  polysaccharide export protein  25.39 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.015315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  31.65 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  29.27 
 
 		 177 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  34.06 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  27.8 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.16 
 
 		 910 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 828 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>