More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0853 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  68.59 
 
 		 191 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  70 
 
 		 191 aa  277  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  68.98 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  63.98 
 
 		 187 aa  255  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  62.7 
 
 		 195 aa  252  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  62.7 
 
 		 196 aa  252  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  66.07 
 
 		 196 aa  250  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  52 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  50.67 
 
 		 213 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  50.64 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  43.16 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  50 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  47.33 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  48 
 
 		 234 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  46.98 
 
 		 247 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  48 
 
 		 235 aa  140  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  48 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  48 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  47.33 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  42.47 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  47.33 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  41.62 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  48.34 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  48.03 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  43.87 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  40.79 
 
 		 216 aa  117  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  38.82 
 
 		 200 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  41.78 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  41.06 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  40.4 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.09 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  34.39 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  36.67 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  34 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.54 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  42.06 
 
 		 419 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  30.82 
 
 		 177 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.18 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.93 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  28.48 
 
 		 177 aa  87.8  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  31.25 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  38.71 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  36.72 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  41 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 417 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 435 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  34.01 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  35.58 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  31.71 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  33.07 
 
 		 437 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  36.13 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  32.89 
 
 		 461 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.31 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  35.54 
 
 		 268 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  35.59 
 
 		 411 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  30.54 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  38.1 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  33.09 
 
 		 276 aa  71.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 344 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  32.03 
 
 		 459 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  34.65 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  34.15 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  36.75 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  36.11 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  33.75 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  39.09 
 
 		 816 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.95 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  32.17 
 
 		 365 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  33.04 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  33.04 
 
 		 415 aa  68.2  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  38.71 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 441 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  35.83 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  35.59 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 429 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  34.33 
 
 		 495 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  34.33 
 
 		 495 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 478 aa  65.1  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.59 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 391 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  31.35 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>