More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4816 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  63.91 
 
 		 257 aa  301  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  36.96 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  43.09 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  33.61 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  34.02 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  38.07 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  36.64 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  43.8 
 
 		 205 aa  99.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  41.28 
 
 		 277 aa  85.9  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.4 
 
 		 177 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  40.32 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  40.94 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  41.46 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  40.94 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  34.32 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  40.94 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  39.84 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  33.73 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  37.98 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  37.29 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.52 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  31.18 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  38.17 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  33.86 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  37.86 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  37.29 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2408  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 211 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  34.52 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  29.28 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  37.29 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  34.01 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  34.01 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  35.9 
 
 		 324 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  33.9 
 
 		 190 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 196 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  26.72 
 
 		 352 aa  72  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  31.21 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  37.9 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1928  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  37.76 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  34.88 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.71 
 
 		 152 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  38.64 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  42.86 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  35.57 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  36.91 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  34.42 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  34.78 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  39.45 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  30.22 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  34.75 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  40.95 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  40.91 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  32.82 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  29.65 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  35.14 
 
 		 423 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  37.93 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  29.84 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  35.14 
 
 		 383 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  35.14 
 
 		 423 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  34.15 
 
 		 803 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.4 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  30.71 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  32.07 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  34.72 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 779 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  33.92 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  35.03 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  31.74 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  31.64 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>