203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0727 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  100 
 
 		 276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  55.12 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  55.95 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  47.95 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  36.47 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  35.34 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  36.19 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  36.98 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  35.79 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  33.59 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  33.21 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  35.43 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  31.14 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  33.47 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  30.56 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  24.89 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  39.17 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.73 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.73 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  35.65 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  30.29 
 
 		 392 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.69 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.86 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.71 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  29.29 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.71 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.23 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.23 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.87 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  35.19 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  36.96 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  33.04 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  32.48 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.32 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.35 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  28.18 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  31.07 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  37.25 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.79 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  23.18 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  33.01 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  33.01 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  31.45 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  26.25 
 
 		 393 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  27.63 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  28.29 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  32.71 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  26.15 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  34.56 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  33.64 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  33.01 
 
 		 376 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  31.34 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  32.74 
 
 		 417 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  31.11 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.37 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 191 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 393 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  32.09 
 
 		 195 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  31.21 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  29.8 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.65 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>