266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2287 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  36.5 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  36.33 
 
 		 265 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  33.59 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  35 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  32.93 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  33.73 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  31.01 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  35.22 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  33.19 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  32.51 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  32.66 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  30.92 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  29.89 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  31.11 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  27.31 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  25.76 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  30.14 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  31.54 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  27.62 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  30.39 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.96 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  32.67 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  28.36 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 189 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  33.92 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  26.98 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.72 
 
 		 429 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  25.84 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  28.04 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  25.66 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  29.47 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  32.69 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  26.88 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  33.33 
 
 		 407 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 344 aa  62  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  27.61 
 
 		 378 aa  62  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.3 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  27.93 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.01 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  24.49 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  24.49 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.71 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  25.87 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.08 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  32.62 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.08 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.55 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.08 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.39 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 358 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  30.91 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  29.38 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.37 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>